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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
14/10/2016 |
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Data da última atualização: |
03/03/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ABREU, F. R. M.; DEUS, K. E. de; PEREIRA, W. J.; SILVEIRA, R. D. D.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C. |
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Afiliação: |
FERNANDA RAQUEL MARTINS ABREU, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; KARINE EVARISTO DE DEUS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; WENDELL JACINTO PEREIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; RICARDO DIOGENES DIAS SILVEIRA; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF. |
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Título: |
Expression of rice genes homologous of Arabidopsis genes previously related to drought tolerance. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Australian Journal of Crop Science, v. 10, n. 9, p. 1266-1271, 2016. |
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ISSN: |
1835-2707 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The identification and validation of candidate genes related to traits of interest is a time consuming and expensive process and the homology among genes from different species can facilitate the identification of genes of the target species from the genomic information of a model species. This study aimed to quantify the expression of homologous rice genes previously related to drought tolerance in Arabidopsis. Five genes (CPK6, PLDa, GluR2, CesA8, and EIN2) were identified in rice by the homology of the amino acid sequence between rice and Arabidopsis. The genotypes Douradão (drought tolerant) and Primavera (drought susceptible) were subjected to a water deficit experiment, and subsequently evaluated for gene expression by qPCR for the five homologous and Lsi1 genes. The qPCR analysis clearly showed that the five homologous genes were expressed in rice, which is an indication that these genes could preserve their function in rice as a response to drought. In Douradão, of the five homologous genes, all but OsGluR2 displayed an increase in the average expression in drought treatment when compared to the control, while in Primavera, the average expression of the five genes did not differ between the control and drought treatment. In Douradão, the OsPLDa1, which showed the higher expression level in drought in relation to the control (10.82), significantly increased the gene expression in the leaf and root tissues as a response to drought, in both vegetative and reproductive stages, whereas in Primavera, this gene was suppressed in both tissues and stages under drought. Therefore, the OsPLDa1 gene was the most important in relation to drought response and is an interesting candidate for further studies in developing rice cultivars that are more tolerant to this stress. MenosThe identification and validation of candidate genes related to traits of interest is a time consuming and expensive process and the homology among genes from different species can facilitate the identification of genes of the target species from the genomic information of a model species. This study aimed to quantify the expression of homologous rice genes previously related to drought tolerance in Arabidopsis. Five genes (CPK6, PLDa, GluR2, CesA8, and EIN2) were identified in rice by the homology of the amino acid sequence between rice and Arabidopsis. The genotypes Douradão (drought tolerant) and Primavera (drought susceptible) were subjected to a water deficit experiment, and subsequently evaluated for gene expression by qPCR for the five homologous and Lsi1 genes. The qPCR analysis clearly showed that the five homologous genes were expressed in rice, which is an indication that these genes could preserve their function in rice as a response to drought. In Douradão, of the five homologous genes, all but OsGluR2 displayed an increase in the average expression in drought treatment when compared to the control, while in Primavera, the average expression of the five genes did not differ between the control and drought treatment. In Douradão, the OsPLDa1, which showed the higher expression level in drought in relation to the control (10.82), significantly increased the gene expression in the leaf and root tissues as a response to drought, in both vegetative and reproductive s... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Gene homology. |
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Thesagro: |
Acido abscisico; Arroz; Oryza sativa; Rendimento. |
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Thesaurus Nal: |
Abscisic acid; Arabidopsis; Quantitative polymerase chain reaction; Rice; Yields. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/148788/1/CNPAF-2016-ajcs.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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| Registros recuperados : 38 | |
| 7. |  | VALDISSER, P. A. M. R.; ZUCCHI, M. I.; PEREIRA, W. J.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P. Caracterização do germoplasma de feijoeiro comum com base em marcadores DArt-Seq. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: UFG: SBMP, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 9. | | PEREIRA, W. J.; BASSINELLO, P. Z.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P. An improved method for RNA extraction from common bean seeds and validation of reference genes for qPCR. Crop Breeding and Applied Biotechnology, Viçosa, MG, v. 17, n. 2, p. 150-158, abr./jun. 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 10. | | DEUS, K. E. de; PEREIRA, W. J.; MITSUZONO, S. T.; VIANELLO, R. P.; LANNA, A. C. Sistema de defesa antioxidativo de plantas de arroz de terras altas (Oryza sativa L.) cultivadas sob deficiência hídrica. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 7., 2013, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2013. p. 93. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 292). Pôster - pós-graduação.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 12. | | SIQUEIRA, B.; PEREIRA, W. J.; BATISTA, K. A.; OOMAH, B. D.; FERNANDES, K. F.; BASSINELLO, P. Z. Influence of storage on darkening and hardening of slow- and regular-darkening carioca bean (Phaseolus vulgasris L.) genotypes. Journal of Agricultural Studies, v. 2, n. 2, p. 87-104, Sept. 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 13. | | ABREU, F. R. M.; DEUS, K. E. de; PEREIRA, W. J.; SILVEIRA, R. D. D.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C. Expression of rice genes homologous of Arabidopsis genes previously related to drought tolerance. Australian Journal of Crop Science, v. 10, n. 9, p. 1266-1271, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 14. | | PEREIRA, W. J.; SIQUEIRA, B. dos S.; DEUS, K. E. de; FERNANDES, K. F.; BASSINELLO, P. Z.; VIANELLO, R. P. Determinação das condições de qRT-PCR para genes envolvidos no fenômeno hard-to-cook em feijão carioca. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 6., 2012, Santo Antônio de Goiás. Resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2012. p. 33. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 275).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 15. | | ARAÚJO, R. B. de; PEREIRA, W. J.; VALDISSER, P. A. M. R.; LANNA, A. C.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P. Validação de genes candidatos para tolerância à seca via qPCR em um amplo grupo de genótipos de feijão submetidos à deficiência hídrica. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 9., 2015, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2015. p. 111. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 309).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 16. | | PEREIRA, W. J.; MELO, A. T. de O.; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, C.; COELHO, A. S. G.; VIANELLO, R. P. Análise ampla do genoma funcional de feijoeiro em condições de deficiência hídrica. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 9., 2015, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2015. p. 108. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 309).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 17. | | DEUS, K. E. de; LANNA, A. C.; ABREU, F. R. M.; SILVEIRA, R. D. D.; PEREIRA, W. J.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P. Molecular and biochemical characterization of superoxide dismutase (SOD) in upland rice under drought. Australian Journal of Crop Science, v. 9, n. 8, p. 744-753, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 18. | | ARAÚJO, R. B. de; LANNA, A. C.; COELHO, G. R. C.; PEREIRA, W. J.; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P. Estudo da expressão e validação de genes candidatos induzidos em condições de deficiência hídrica em feijão (Phaseolus vulgaris L.). In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 10., 2016, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2016. p. 42. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 311).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 19. | | OLIVEIRA, J. A. V. de; ABREU, F. R. M.; PEREIRA, W. J.; SILVEIRA, R. D. D.; MENDONÇA, J. A.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C. Expressão de genes homólogos de Arabidopsis em arroz relacionados ao aumento do potencial produtivo. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 9., 2015, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2015. p. 126. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 309).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 20. | | VALDISSER, P. A. M. R.; PEREIRA, W. J.; MORAIS JUNIOR, O. P. de; MENDONÇA, J. A.; SARTORI, D. E. L.; LIMA, LUANN V. V. O.; BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, C.; ZUCCHI, M. I.; VIANELLO, R. P. Análise de associação genômica ampla (GWAS) para tolerância à seca em feijoeiro comum. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 12., 2017, Piracicaba. Produtividade e sustentabilidade da cultura do feijão: do campo para a mesa: resumos. Piracicaba: CENA: IAC, 2017. p. 67. CONAFE| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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